吉林财经大学审计处是校内单设的内部审计机构，是学校于2008年将内部审计从纪检、审计监察处分离出来成立的处室，负责开展学校内部审计工作。审计处编制4人，现有审计人员3人，主管校领导为童猛校长。

审计处坚持“为学校领导决策服务、为各部门完善管理服务、为学校建设发展服务”的宗旨，以“明德崇实”为理念，以“围绕中心、服务大局、发现问题、完善机制、依法审计、促进规范”为审计工作原则，在学校党委、行政和上级主管部门的领导下，依据国家法律法规和政策，以及上级主管部门和学校的规章制度，独立开展内部审计工作，向学校领导负责和报告工作，并接受吉林省审计厅内部审计指导监督处、吉林省教育厅审计处和吉林省内部审计协会的业务指导和监督。

     吉林财经大学审计处于2012年被吉林省教育厅授予“全省教育内部审计工作先进集体”荣誉称号。